Niguliste saal
Niguliste muuseumi ainulaadse akustikaga suur saal on Eesti suursugusemaid kontserdipaiku. Hoones asub kaks orelit: Rieger-Klossi peaorel ja kooriruumi väike barokkorel. Avar ja mitmeotstarbeline Niguliste saal sobib erinevateks kultuuri- ja teadusürituste, kontsertide ja eriliste tähtpäevade korraldamiseks. Ruum mahutab kuni 280 külalist. Toolid saab paigutada vastavalt tellija soovile.
Niguliste Antoniuse kabel
Antoniuse kabel sobib kultuuri- ja teadusüritusteks ning väiksemateks kontsertideks. Ruum mahutab kuni 120 külalist.
Niguliste torni kolmas korrus
Torni vahekorrus, kust avaneb kaunis vaade Tallinna linnale ja merele, sobib väiksemateks esitlusteks, seminarideks vms ning mahutab kuni 20 külalist. Siin saab üritusi korraldada ka siis, kui muuseum on tavakülastajatele avatud.
Toitlustust muuseum ei korralda. Catering-teenust võib tellida endale sobivalt teenusepakkujalt.